Ergänzend zu ihrem Lehrauftrag pflegt und nutzt die HTA-FR ein grosses und breitgefächertes Netzwerk von Partnern für ihre angewandte Forschung und Entwicklung (aF&E). Die Forschungsinstitute und Kompetenzzentren der HTA-FR stellen sich den aktuellen technologischen und wissenschaftlichen Herausforderungen und entwickeln massgeschneiderte Lösungen für die Bedürfnisse der regionalen und nationalen Wirtschaft. 

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Die HTA-FR arbeitet im Bereich angewandte Forschung sowohl mit multinationalen und regionalen Unternehmen als auch mit öffentlichen Einrichtungen zusammen.